135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0233 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  100 
 
 
197 aa  377  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.03 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.03 
 
 
191 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.59 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.07 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.64 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.71 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  35.16 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  28.72 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  32.11 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  32 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.14 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  39.44 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  37.14 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  35.76 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  37.58 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.71 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  34.43 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  31.36 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.61 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  37.04 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.46 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  30.05 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  37.57 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  38.38 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.46 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  33.51 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.43 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  33.33 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.61 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  33.33 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.4 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.4 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  34.94 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  32.77 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  32.77 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  32.77 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.39 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  37.42 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  36.07 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  34.91 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  37.64 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.4 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  33.53 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  30.64 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.13 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  31.01 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.78 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  32.24 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  30.73 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  30.73 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  35.67 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.39 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  36 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  36 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  36 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  37.02 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  31.18 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  32.39 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  36.71 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  41.48 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  29.75 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  31.69 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.62 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  34.32 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  27.62 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.68 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  32.9 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.94 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.02 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.33 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  29.82 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  29.82 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  33.91 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  37.8 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  35.76 
 
 
145 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  35.04 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.93 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  34.1 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.6 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  30 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  37.14 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  32.54 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  32.51 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  29.35 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  30.87 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  27.84 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  33.52 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  30.53 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  32.74 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  40.71 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  33.12 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  40.59 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  29.45 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  40.59 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>