184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0586 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  100 
 
 
187 aa  362  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  50 
 
 
187 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  46.3 
 
 
184 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  40.12 
 
 
182 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  45.96 
 
 
197 aa  121  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  44.24 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  43.45 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  40.23 
 
 
179 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  46.29 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  46.78 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  46.29 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  41.48 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  37.71 
 
 
169 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  44.08 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  42.24 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  45.86 
 
 
182 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  42.35 
 
 
210 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  39.41 
 
 
189 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  41.77 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  42.58 
 
 
169 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  39.2 
 
 
190 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40.83 
 
 
199 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  44.52 
 
 
192 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  41.18 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  44.16 
 
 
191 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  37.58 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.36 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  36.26 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  36.36 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.67 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  39.89 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  42.65 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  42.65 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  42.65 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  42.65 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.95 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.07 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.95 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  43.41 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36.09 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  34.9 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  39.43 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  47.32 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  39.73 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  41.91 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  41.91 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  37.79 
 
 
187 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  46.43 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  38.93 
 
 
206 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  37.2 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  35.8 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  41.1 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  45.54 
 
 
197 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  36.42 
 
 
215 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.6 
 
 
205 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.88 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  42.07 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.86 
 
 
212 aa  90.9  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.1 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.52 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  38.24 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.57 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  40.27 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  37.79 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  37.97 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  42.03 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  36.87 
 
 
224 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  39.19 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  39.29 
 
 
197 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  42.61 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  40.49 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.67 
 
 
231 aa  84.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  34.09 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  34.09 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  37.28 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  42.86 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40.82 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.97 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  38.37 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  37.58 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  39.11 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  39.53 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  34.05 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  34.05 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  36.69 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  36.47 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  37.28 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  39.53 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  37.06 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  37.06 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  37.06 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  39.33 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  35.06 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  36.69 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  36.77 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.76 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.32 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  38.46 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.58 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  36.65 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>