183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0129 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  100 
 
 		 169 aa  323  6e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  100 
 
 		 169 aa  323  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  46.11 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  43.45 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  41.72 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  44.38 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  46.29 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  48.32 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  43.71 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  41.48 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.88 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  35.93 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  42.5 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  39.89 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  40.12 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  40.88 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  35.8 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  43.15 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  44.67 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  39.66 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  41.67 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  41.57 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  43.35 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  38.46 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  42.86 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  37.93 
 
 		 192 aa  90.9  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  45.18 
 
 		 193 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  37.28 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  40.74 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  35.63 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.97 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  48.04 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  43.98 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  37.35 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  42.17 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  44.93 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  39.13 
 
 		 210 aa  84.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  39.74 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  41.82 
 
 		 193 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.5 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  39.86 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.47 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  37.89 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.59 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  41.35 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32.18 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  31.03 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.68 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  31.03 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  31.03 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  40.14 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  41.14 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  39.87 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  36.72 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  36.36 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  36.72 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.03 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.03 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.69 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  35.94 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.93 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  39.19 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  37.58 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  35.94 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.1 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.84 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  37.04 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  38.24 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.5 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  48.84 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  35.16 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  38.89 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.9 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  37.33 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  44.94 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.57 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  31.28 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  33.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  33.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  35.67 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.32 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.27 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.62 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  35.85 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  38.69 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.14 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.41 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  28.18 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  35.66 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.9 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.62 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.04 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  35.92 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  32.95 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  32.95 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  34.18 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  35.09 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  37.4 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>