182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  377  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  47.64 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.46 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  42.64 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  44.67 
 
 
191 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  42.86 
 
 
207 aa  121  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  46.77 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  41.58 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  43.94 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.83 
 
 
184 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  43.98 
 
 
197 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  42.05 
 
 
200 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  42.35 
 
 
187 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  43.88 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  43.53 
 
 
204 aa  104  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  44.22 
 
 
205 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  28 
 
 
190 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  43.92 
 
 
196 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  39.69 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  45.95 
 
 
198 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  38.78 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  39.71 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.46 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  36.91 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  32.32 
 
 
182 aa  89  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  45.34 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  38.51 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.22 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.56 
 
 
192 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.22 
 
 
191 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  39.88 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  35.12 
 
 
175 aa  84  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.91 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  47.5 
 
 
187 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.44 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.79 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.71 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  33.73 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.79 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.76 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  38.31 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.24 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.43 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  32.74 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  32.74 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.14 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32.45 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.82 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  38.31 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0108  hypothetical protein  32.42 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.307903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  37.28 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  30.92 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  30.92 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  28.8 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.27 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.92 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.92 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.92 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  40.96 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  31.58 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  34.91 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  32.03 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  35.75 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.95 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  32.47 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  35.75 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  42.41 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.11 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  31.82 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  35.9 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  33.84 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  44.14 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  31.17 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  37.01 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.3 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.74 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  53.25 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.32 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  32.95 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  32.95 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.19 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.22 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  32.14 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  32.14 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.85 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  32.74 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.87 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  31.55 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  31.55 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  31.55 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.16 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  39.71 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.17 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  31.85 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  35.8 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.02 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.84 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.2 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.22 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>