181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1014 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  100 
 
 
169 aa  323  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  58.33 
 
 
178 aa  193  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  53.25 
 
 
169 aa  179  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  47.93 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  54.17 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  44.24 
 
 
187 aa  120  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  42.68 
 
 
184 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  38.46 
 
 
187 aa  101  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.88 
 
 
169 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.88 
 
 
169 aa  101  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  38.73 
 
 
194 aa  94.7  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  39.52 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.45 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.7 
 
 
197 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  41.83 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  39.44 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.66 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  35.96 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  40.38 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.15 
 
 
184 aa  84.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  42.65 
 
 
206 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  35.71 
 
 
182 aa  84.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.71 
 
 
205 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.75 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.13 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  39.2 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  37.95 
 
 
193 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.58 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.31 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.65 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.58 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  32.77 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.8 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  40.4 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  39.71 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.46 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  43.48 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  38.55 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  39.35 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.01 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  37.95 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  37.42 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  35.88 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.26 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  42.22 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  37.58 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  39.74 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.26 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.76 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  42.31 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  39.69 
 
 
203 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  36.2 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  38.12 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  36.77 
 
 
203 aa  70.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  36.81 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  36.81 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  36.81 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  36.81 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  36.81 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  36.81 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  32.18 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  35.9 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  37.06 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  37.06 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.1 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.32 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.3 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  41.3 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  35.07 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  36.11 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  35.43 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  39.86 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  34.18 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  35.66 
 
 
197 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  34.5 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.46 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  35.4 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  36.14 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.23 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  31.69 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.51 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  31.03 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  33.14 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  33.81 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  33.77 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  34.64 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  35 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  31.97 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.36 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.91 
 
 
187 aa  63.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  36.88 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  34.29 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  38.69 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.21 
 
 
191 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  36.62 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.58 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.16 
 
 
216 aa  61.6  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  36.55 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>