174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3097 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  67.57 
 
 
187 aa  241  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  47.83 
 
 
192 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  40.11 
 
 
184 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  46.2 
 
 
190 aa  132  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  42.05 
 
 
188 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  38.51 
 
 
202 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  38.29 
 
 
187 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  37.79 
 
 
201 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.36 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  37.75 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  41.78 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.21 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.59 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.43 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.51 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.97 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  36.88 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  62.2 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  36.88 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  31.32 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.32 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  31.32 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  31.32 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.32 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  40 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  37.86 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  31.87 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  39.16 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  30.77 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  31.32 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32.24 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  80.9  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  30.05 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  30.77 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.93 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.93 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  32.97 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  32.97 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.21 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.97 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.15 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.43 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  39.39 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.29 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  31.84 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  31.89 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  31.89 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  31.89 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  41.22 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.22 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  43.69 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.11 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35.44 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.7 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  36.11 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.36 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.17 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  35.88 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.55 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  33.76 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.57 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  54.55 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  38.92 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  29.38 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  33.9 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.58 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  27.81 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  32.96 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  36.99 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  33.33 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  33.33 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  33.33 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.31 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.04 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  36.99 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  38 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  36.99 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  32.91 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  29.94 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  29.94 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  36.5 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  37.89 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  47.52 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.53 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  35.88 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.87 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  48.53 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  35.65 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  46.53 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  46.53 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  32.8 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  33.95 
 
 
208 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  46.34 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  27.96 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  45.36 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  31.77 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  38.58 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.76 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  35.16 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>