26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1727 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  100 
 
 
193 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  48.77 
 
 
206 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  43.3 
 
 
194 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  42.55 
 
 
216 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  42.55 
 
 
216 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  42.11 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  40.53 
 
 
220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  41.67 
 
 
196 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  40.96 
 
 
190 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  36.36 
 
 
189 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  39.01 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  31.67 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10201  hypothetical protein  32.07 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0725232  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.57 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  39.29 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  34.87 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09451  hypothetical protein  25.53 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288227  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09471  hypothetical protein  25.53 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  43.84 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  31.88 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.1 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  34.52 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0886  biotin synthase  29.55 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0583156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.26 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0332  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.36 
 
 
544 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>