78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16541 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  360  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  65.79 
 
 
189 aa  222  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  65.26 
 
 
189 aa  205  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10201  hypothetical protein  50.53 
 
 
190 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0725232  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  38.64 
 
 
176 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  38.07 
 
 
176 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  38.95 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  40.96 
 
 
193 aa  94.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  34.59 
 
 
216 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  34.59 
 
 
216 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  33.86 
 
 
220 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  34.41 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  34.62 
 
 
195 aa  89  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  36.67 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09451  hypothetical protein  29.68 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288227  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09471  hypothetical protein  33.64 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0886  biotin synthase  37.38 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0583156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.76 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  32.86 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  33.74 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09971  hypothetical protein  25.15 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  32.82 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.27 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  40 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  33.06 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  29.25 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.64 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  39.51 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.69 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  27.89 
 
 
201 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.37 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  28.57 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  40.54 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.78 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  36.7 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  36.19 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  40.4 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  45.07 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.01 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  27.72 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  46.97 
 
 
182 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  27.48 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  27.72 
 
 
197 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.35 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.37 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  26.73 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  37.04 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.78 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  25.96 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  25.96 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  27.83 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  25.96 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.94 
 
 
179 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  26.73 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.82 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  26.73 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  32.31 
 
 
205 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  40.54 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.98 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  36.27 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  33.33 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.98 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  31.31 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  32.29 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  25.74 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  34.34 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  40.57 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  32.29 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  24.75 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.33 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  31.19 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.78 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  39.13 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.24 
 
 
199 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  30.77 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  44.83 
 
 
179 aa  42  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  45.16 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>