65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1257 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  100 
 
 		 189 aa  362  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  71.81 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  65.26 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10201  hypothetical protein  45.26 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0725232  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  39.2 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  39.2 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  38.3 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  37.5 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  35.79 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  35.79 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  35.11 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  36.84 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  32.48 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  33.76 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  39.37 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  28.66 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0886  biotin synthase  31.36 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0583156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09471  hypothetical protein  28.24 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  37.89 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09451  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  35.71 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.34 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.42 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  29.11 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09971  hypothetical protein  29.7 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.6 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  32.23 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  29.87 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  35.4 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.29 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  28.16 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  37.35 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  37.37 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.81 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.51 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.78 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.07 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  43.66 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  33.33 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  33.59 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  33.59 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  35.14 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.24 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.64 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  33.08 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  34.02 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  41.1 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  39.05 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.54 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  33.87 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.65 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.24 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  40.51 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  38.82 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.05 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  40.48 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.05 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  43.28 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  27.88 
 
 		 184 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  31.09 
 
 		 192 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.96 
 
 		 204 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.78 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  35.64 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>