170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2875 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  100 
 
 
202 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  65 
 
 
201 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  48.45 
 
 
198 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  47.94 
 
 
197 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  46.91 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  46.91 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  46.91 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  46.91 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  46.91 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  47.94 
 
 
197 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  46.91 
 
 
197 aa  177  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  46.91 
 
 
197 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  47.42 
 
 
197 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  39.18 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  36.56 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  39.87 
 
 
187 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  38.51 
 
 
187 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  37.16 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  35.84 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  38.66 
 
 
188 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  36.46 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  43.22 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.97 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  43.4 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.62 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.54 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.9 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.9 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38.52 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.65 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.61 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  33.88 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  31.35 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  52.78 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.81 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.9 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.92 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.26 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38.46 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  30.27 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  31.35 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  31.35 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  35.37 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  40.18 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36.94 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  33.15 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  40 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  33.08 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  34.19 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  30.81 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.81 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.81 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.04 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  32.8 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  39.81 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  34.51 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.26 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  44.78 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.6 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  40 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  32.14 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  37.78 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.25 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  41.1 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.83 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  29.79 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  33.16 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.75 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  33.33 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.04 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  35.24 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  37.4 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  38.18 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  33.08 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  30.57 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  29.74 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.85 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  41.78 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  37.14 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.01 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.36 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  31.06 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  30.59 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  30.54 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  29.47 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.89 
 
 
180 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  27.36 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.57 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  31.68 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.33 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.69 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  38.27 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  28.95 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  35.48 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  31.87 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  27.98 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  29.38 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  29.38 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>