179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3677 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  100 
 
 		 182 aa  352  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  43.86 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.16 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.33 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.04 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  38.22 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  36.52 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.42 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  39.1 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  40.26 
 
 		 197 aa  97.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.96 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  37.21 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.71 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  34.44 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.29 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  33.92 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  36.21 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.59 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  35.1 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40.28 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  34.68 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.66 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.97 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.97 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  32.32 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.42 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.5 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  39.19 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  35.12 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.86 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  36.14 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  36.14 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.9 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  37.91 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  34.53 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  33.52 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  32.93 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  30.59 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  38.98 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  32.37 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  37.13 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  35.62 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  34.93 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  35.12 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  36.64 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.97 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  31.71 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  31.71 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.55 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  39.23 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  32 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  35.12 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  33.94 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.54 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  39.29 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  37.93 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  35 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.79 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  36.05 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  31.43 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.35 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  30.05 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  31.64 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  28.34 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  35.62 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.3 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  34.48 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  30.91 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  33.12 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  35.37 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  33.33 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  33.78 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  34.73 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  33.9 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  32.2 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  28.88 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  36.67 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  35.17 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  35.77 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  31.93 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  34.62 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  27.27 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  40.43 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.29 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  36.26 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  36.05 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  36.23 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  33.76 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  36.92 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  31.82 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  33.76 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  30.56 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  29.5 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>