178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4332 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  100 
 
 
188 aa  363  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  51.98 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  45.51 
 
 
184 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  42.05 
 
 
187 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  43.82 
 
 
190 aa  148  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  41.4 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  38.66 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.93 
 
 
201 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  40.43 
 
 
187 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  37.93 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  33.68 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  38.24 
 
 
169 aa  92.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  38.24 
 
 
169 aa  92.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  35.52 
 
 
198 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  33.68 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  34.21 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  33.16 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.32 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  33.16 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  32.63 
 
 
197 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  32.63 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  32.63 
 
 
197 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  33.68 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  33.16 
 
 
197 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.34 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.91 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  31.41 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.76 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  41.07 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.41 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.58 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.39 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  31.82 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.12 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.07 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.95 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  31.82 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.74 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  36.3 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  44.9 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  36.3 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  43.06 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  33.52 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.57 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  33.56 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  48.51 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40.87 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  27.07 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  47.52 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  47.52 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  37.69 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  37.23 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.61 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.02 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  35.96 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.51 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  41.94 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  40.45 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.72 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  33.1 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  39.32 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  37.86 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  31.25 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  31.78 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  33.1 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.86 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.57 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  41 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  33.33 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  47.62 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.67 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  32.57 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  35.25 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  34.43 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  46.03 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.37 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0108  hypothetical protein  31.36 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.307903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  32.85 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  30.68 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  32.93 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  38.32 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  40.17 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  38.89 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  31.33 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  43.18 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  29.71 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.29 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  30.69 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  39.62 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  39.77 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.91 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  35.71 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  36.52 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  34.21 
 
 
215 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>