166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0169 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  100 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  59.09 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0108  hypothetical protein  43.92 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.307903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  44.87 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  40.72 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  41.06 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.07 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  42.35 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  35.98 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  35.45 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  35.45 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  35.45 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  35.45 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  33.86 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  34.92 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  34.92 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  34.92 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  34.92 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  34.39 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  40 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.16 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.21 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.35 
 
 		 169 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.35 
 
 		 169 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  39.42 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.13 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.41 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.98 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.71 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.78 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.86 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  37.93 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  36.16 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40.62 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  34.88 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  35.63 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  34.57 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.34 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.46 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.46 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.46 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  33.71 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.08 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.69 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.29 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.51 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  33.9 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  33.9 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.82 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.28 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  34.59 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  35.16 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.25 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  31.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  32.52 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  35.76 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  50 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.41 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  41.94 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.15 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  34.67 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  33.33 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36.31 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  36.11 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  35.14 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  34.58 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  34.58 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  33.91 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.82 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.48 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  29.58 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.77 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.82 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.86 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  30.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  30.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  30.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  36.08 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  35.77 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  28.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  34.32 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.54 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  33.61 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  33.75 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  30.9 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.79 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  33.92 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  31.65 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  32.52 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.54 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  29.89 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  29.89 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  34.15 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  31.85 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  29.7 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  26.62 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  33.06 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  31.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>