61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0147 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  97.73 
 
 		 176 aa  317  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10201  hypothetical protein  42.61 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0725232  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  38.07 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  40.23 
 
 		 189 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  39.2 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  38.96 
 
 		 220 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  34.78 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  38.75 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  34.81 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  32.08 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  32.08 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09971  hypothetical protein  39.05 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  38 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0886  biotin synthase  39.1 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0583156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09471  hypothetical protein  37.9 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  31.11 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09451  hypothetical protein  37.1 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.09 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  32.06 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  30.43 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  33.06 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.19 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  27.94 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.86 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.91 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  44.78 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  29.57 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  32.63 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.05 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  25.74 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  29.51 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.75 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  29.84 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.29 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  25 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  25 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  36.84 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  31.16 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  29.03 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  29.59 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  26.28 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  33.02 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  27.56 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  26.88 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  27.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  30.91 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  27.94 
 
 		 190 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  34.21 
 
 		 198 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  30.91 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.11 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  32.35 
 
 		 208 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  30.17 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.91 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  32.29 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  32.93 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  30.23 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  29.77 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  36.47 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  27.74 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>