165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1732 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  100 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  67.4 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  63.82 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  65.62 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  65.62 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  65.62 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  47.83 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.93 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.56 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  38.42 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.15 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.43 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  39.08 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.98 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  46.3 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.98 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  42.86 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  43.86 
 
 		 180 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.03 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  33.71 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  38.2 
 
 		 189 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  35.68 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  32.62 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  32.62 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  33.15 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  32.62 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  33.15 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  38.38 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  33.16 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  44.38 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  36.07 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  42.08 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  39.44 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.31 
 
 		 192 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.7 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  38.07 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  39.52 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.16 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  34.68 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  37.21 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  39.85 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  42.48 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.34 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.5 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.99 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.84 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.84 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.03 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  37.22 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  34.73 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  34.73 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  39.53 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.04 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  34.3 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  35.96 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  34.88 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  35.66 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  40.45 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  40.45 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.06 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.78 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  34.74 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.52 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  38.92 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  34.31 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  39.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  31.68 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.55 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  31.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.12 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.08 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  32.46 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  31.03 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  29.09 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  30.07 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  32.05 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  43.48 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.57 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  46.74 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  31.25 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.09 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  45.24 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.75 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.05 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  47.56 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  29.78 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  31.07 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  28.92 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  46.67 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  31.62 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  33.7 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  34.16 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  31.91 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.07 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  34.17 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  32.85 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  38.71 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>