144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0733 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  100 
 
 
190 aa  362  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  53.33 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  46.29 
 
 
179 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  47.59 
 
 
179 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  41.99 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  40.23 
 
 
187 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.08 
 
 
187 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  38.46 
 
 
182 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  34.91 
 
 
192 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.58 
 
 
187 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  39.77 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  36.93 
 
 
184 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  36.93 
 
 
184 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  34.91 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  32.43 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  39.16 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.57 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.57 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.83 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.57 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  33.89 
 
 
201 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  33.51 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  35.16 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  32.78 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  32.02 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.69 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.43 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  39.66 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.81 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  36.27 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  31.87 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  31.87 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  31.87 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  28.08 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  32.12 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.88 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.04 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.04 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.04 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.04 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  40.97 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  32.62 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  32.62 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.04 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  30.17 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  45.26 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  34.03 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  26.46 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.18 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.41 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  43.01 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.33 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.33 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  34.62 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  32.43 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  29.3 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  35.48 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  30.29 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  38 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  32 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.14 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  32.18 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  32.65 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  35.48 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  31.87 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  27.84 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.46 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.87 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  30.99 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  30.99 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  30.9 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.33 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  30.6 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  27.87 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  34.46 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  31.94 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.22 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  45.28 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  29.32 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  39.13 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  26.54 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  34.51 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  33.12 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  43.94 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  32.32 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40 
 
 
182 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.38 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  30.46 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  27.88 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  26.74 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  33.81 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  31.4 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  28.77 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  43 
 
 
193 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  35.11 
 
 
182 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.31 
 
 
179 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  43.43 
 
 
193 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>