129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1953 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  53.33 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  47.16 
 
 
179 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  44 
 
 
179 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  45.45 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  40.68 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  40.68 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  40.88 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.93 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.39 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  39.13 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.83 
 
 
191 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.06 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.43 
 
 
187 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.63 
 
 
187 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.04 
 
 
187 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  39.02 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  37.16 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  44.44 
 
 
179 aa  94  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.71 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  36.78 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30.86 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  35.06 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  30.94 
 
 
231 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  35.26 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.48 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.48 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.48 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  33.9 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.1 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.1 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.11 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.52 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.46 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  28.89 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  34.03 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  32.11 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  38.06 
 
 
222 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.81 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.23 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.98 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  27.87 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  30.12 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  30.12 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  30.12 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.31 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  29.71 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  28.48 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  30.17 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  31.87 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  32.22 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  30.82 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  32.22 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  29.78 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  31.65 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  31.17 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  28.99 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  26.67 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  30.51 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.19 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  36.36 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  30.65 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  30.29 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.85 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  31.69 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  29.67 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  30.34 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  30.34 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  30.3 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  26.4 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  30.3 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  31.93 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  27.5 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  29.73 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  33.94 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  30.99 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  30.68 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  28.81 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  31.29 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  25.45 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  27.63 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  36.36 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  24.73 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  29.01 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  28.18 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  29.94 
 
 
193 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  27.59 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  33.57 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  31.13 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  26.95 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  27.22 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  28.81 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  28.33 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  26.32 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  35.23 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  35.05 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  27.52 
 
 
199 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  30.48 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>