155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1651 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  100 
 
 		 203 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.36 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.98 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.5 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.88 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  35.33 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.36 
 
 		 191 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  29.84 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.86 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  30.61 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.25 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  31.76 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  35.23 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  33.7 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  46.32 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  32.78 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  34.68 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  36.48 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  30.54 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  28.18 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  28.18 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  33.33 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.29 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  33.92 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.05 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  35.11 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  32.57 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  34.91 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  32.61 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.29 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.36 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  33.71 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  33.71 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  32.3 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  31.4 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  33.33 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  33.33 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  33.33 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  35.71 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  30.48 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  34.62 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30.39 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  50 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  31.95 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  32.05 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  30.39 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  32.54 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.16 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  33.15 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  30.73 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  35.91 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  30.85 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  31.95 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  45.16 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  35.36 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  35.36 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  35.36 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  30.34 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  31.72 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  31.01 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.94 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  28.57 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  32.54 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  31.28 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  46.74 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.81 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.81 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  34.48 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  28.34 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  33.73 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  45.78 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  34.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.98 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  33.7 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  38.24 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.77 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  37.25 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  30.36 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  45.26 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  29.5 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  43.37 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.86 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  34.44 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  28.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  31.02 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.08 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  30.11 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  46.94 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  32.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  35.03 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  46.94 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  29.79 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  29.79 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  31.36 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  32.26 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  30.32 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  30.18 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>