145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0398 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  100 
 
 
179 aa  342  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  47.67 
 
 
179 aa  155  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  44 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  46.99 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.87 
 
 
187 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  39.41 
 
 
182 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.46 
 
 
187 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  38.24 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  37.95 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  37.95 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  38.73 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  37.57 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  36.42 
 
 
191 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  40.8 
 
 
182 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.81 
 
 
187 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  38.37 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  35.15 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  38.15 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  37.57 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  37.57 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  37.57 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  36.99 
 
 
191 aa  94  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  36.99 
 
 
191 aa  94  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  31.89 
 
 
192 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  36.21 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  37.8 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.33 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  33.9 
 
 
184 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  34.09 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  36.47 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  36.47 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  37.42 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.07 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  31.46 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  33.97 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  29.02 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.43 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  32.35 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  32.94 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.54 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  33.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  33.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  33.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  34.48 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.17 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.83 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  35.43 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  30.86 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  31.64 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.36 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  32.91 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  31.68 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.5 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  32.92 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  32.57 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  31.47 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  28.73 
 
 
212 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  31.58 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  40 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  32.74 
 
 
221 aa  61.6  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  31.82 
 
 
222 aa  61.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  34.48 
 
 
205 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  30.59 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  30.59 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  29.78 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  31.97 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.61 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  33.89 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  31.79 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  34.15 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  30.19 
 
 
202 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  32.17 
 
 
199 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  29.78 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  34.06 
 
 
203 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  30.28 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  30.22 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  31.25 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  32.39 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  36.05 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  28.86 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  29.08 
 
 
197 aa  54.3  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  35.78 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  35.92 
 
 
205 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  30.19 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  36.19 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.37 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  28.36 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  29.11 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.94 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  26.88 
 
 
197 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
192 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  27.84 
 
 
216 aa  51.6  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  28.57 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  33.8 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  27.54 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  27.97 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  25.75 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  33.79 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  30.34 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>