165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1540 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  100 
 
 		 194 aa  367  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  99.48 
 
 		 194 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  71.88 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  48.02 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  44.81 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  45.41 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  41.01 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  42.13 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  46.59 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  41.48 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  45.05 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  43.01 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  41.3 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  40.22 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  42.42 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  48.1 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  39.9 
 
 		 231 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.67 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  39.44 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  44.44 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.76 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  35.5 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  39.41 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  46.07 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  43.37 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  43.26 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  36.09 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  36.09 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  42.7 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  42.7 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  38.33 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  42.13 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  38.54 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  42.13 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  42.13 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  42.13 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  38.25 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.94 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  38.66 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  36.47 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.52 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  41.67 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  39.07 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  39.07 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  47.16 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  39.07 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  46.59 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.13 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  36 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  43.78 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  42.39 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.33 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  47.19 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40.56 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  32.52 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  38.73 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.06 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.87 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  35.48 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  41.44 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.98 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.94 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.81 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  39.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.32 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  36.42 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  34.97 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  38 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.36 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.44 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.56 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  47.18 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  46.47 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  46.67 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.52 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.52 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.31 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.02 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40.26 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  34.48 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.67 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  35.33 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  46.24 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.65 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.81 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  39.74 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  41.14 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.65 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  38.46 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  45.83 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.97 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.18 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.23 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  35.76 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  46.23 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  46.23 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  46.15 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.47 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>