174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0539 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  100 
 
 
193 aa  342  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  97.69 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  96.89 
 
 
193 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  53.59 
 
 
182 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  53.94 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  45.18 
 
 
169 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  45.18 
 
 
169 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.02 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.45 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.8 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  39.52 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.5 
 
 
184 aa  104  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  41.86 
 
 
178 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  48.04 
 
 
180 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.36 
 
 
167 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.86 
 
 
182 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.91 
 
 
184 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  44.57 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.05 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  47.14 
 
 
203 aa  98.2  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  34.25 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40.94 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  41.32 
 
 
169 aa  92.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  44.76 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.65 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.91 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.53 
 
 
192 aa  89  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  43.57 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  45 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.44 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  35.03 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  40.38 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  36.87 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  40.15 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  41.14 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  41.14 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.32 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  42.86 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  36.76 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  48.94 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  41.42 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  42.14 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  45.86 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  39.43 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  44.59 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  39.35 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  29.82 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  35.03 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  37.79 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  41.22 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  37.93 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.58 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  31.58 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.58 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  38.92 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.58 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  31.58 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  31.58 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  39.77 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  33.33 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  33.33 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  39.86 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  33.33 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  36.26 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  41.1 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  39.1 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  28.65 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  39.75 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  40 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  47.3 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  33.33 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.75 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  43.28 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  31.88 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.37 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  32.08 
 
 
165 aa  72  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  40.27 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  39.62 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  36.9 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.37 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  32.86 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.14 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  43.7 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.81 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  45.83 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  45.6 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  44.38 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  34.66 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  36.21 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  40.65 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.33 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.57 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.21 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.43 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  43.4 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  38.16 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  45.97 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  42.96 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  37.75 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>