170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4638 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  100 
 
 		 203 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  80.25 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  59.02 
 
 		 191 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  54.59 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  56.59 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  56.28 
 
 		 189 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  53.8 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  49.71 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  46.7 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  50.29 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  50.29 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  52.84 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  46.63 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  45.81 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.38 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  46.59 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  43.28 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  47.62 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  50 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  43.32 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  42.65 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.65 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  42.78 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  39.63 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  43.82 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  41.46 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  39.51 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.35 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  39.33 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.62 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  37.14 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  39.68 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  40.74 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  37.91 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  43.42 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  34.75 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  41.45 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  35.59 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.59 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  41.32 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  48.91 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.18 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  38.2 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.64 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  37.14 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  32.14 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  34.95 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  43.31 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.43 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  36.16 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.72 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.62 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.65 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.46 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.86 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.86 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.18 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.73 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.81 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.75 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  33.93 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  40.85 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  34.08 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  31.06 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.04 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.46 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  37.42 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.78 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.36 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  28.89 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  34.3 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.18 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  31.11 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  41.29 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.15 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  31.11 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  30.56 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.56 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.56 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.67 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  34.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.6 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  33.82 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  28.89 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  30.53 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  33.54 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.81 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  34.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  34.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  30.77 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  29.76 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  32.32 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  39.13 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  32.5 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  37.04 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  29.05 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  26.25 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>