169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1529 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  100 
 
 
188 aa  350  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  52.94 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  50.81 
 
 
184 aa  168  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  49.47 
 
 
187 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  44.79 
 
 
191 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  45.31 
 
 
191 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  46.2 
 
 
191 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  48.4 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  52.13 
 
 
187 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  42.27 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  45.31 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  39.67 
 
 
184 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  39.67 
 
 
184 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  51.6 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  47.51 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  45.31 
 
 
191 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  39.77 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  44.79 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  44.79 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  43.75 
 
 
191 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  43.75 
 
 
191 aa  131  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  43.75 
 
 
191 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  44.62 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  43.26 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  41.71 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  47.49 
 
 
182 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  50.85 
 
 
179 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  46.11 
 
 
199 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  42.47 
 
 
197 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  45.73 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  50.57 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  47.7 
 
 
180 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  41.71 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  46.59 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  40.76 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  41.14 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  45.95 
 
 
194 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  45.95 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  40.44 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  36.22 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  35.43 
 
 
189 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40 
 
 
224 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  43.14 
 
 
202 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  43.14 
 
 
202 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  43.14 
 
 
202 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  48.48 
 
 
222 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  39.44 
 
 
208 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.96 
 
 
179 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.43 
 
 
189 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.59 
 
 
216 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  56.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.84 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.42 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38.82 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  40.64 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  51.06 
 
 
144 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.29 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  41.72 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  39.53 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  41.1 
 
 
207 aa  91.3  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.75 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  44.23 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.33 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.91 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  41.25 
 
 
192 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  47.7 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  47.7 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.67 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  31.25 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.67 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.67 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  50.55 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.72 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  38.34 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.61 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  38.25 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  36.22 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  29.89 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.31 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  38.1 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  48.39 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  34.94 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  40 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  37.5 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  32.26 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  35.15 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  46.24 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  34.64 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  36.02 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.67 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.67 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  33.93 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  31.07 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  33.16 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  38.89 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.18 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  37.12 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  39.68 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  36.31 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  35.9 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>