79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1212 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  100 
 
 
189 aa  353  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  71.81 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  65.79 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10201  hypothetical protein  45.26 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0725232  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  40.8 
 
 
176 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  40.23 
 
 
176 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  35.03 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  39.47 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  34.76 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  39.47 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  39.01 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  34.81 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  34.84 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0886  biotin synthase  28.99 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0583156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09471  hypothetical protein  27.81 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09451  hypothetical protein  28.4 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  31.61 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  39.68 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.59 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  30.95 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  33.94 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.25 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  32.26 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09971  hypothetical protein  23.96 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  32.31 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.29 
 
 
197 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.21 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  34.46 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  40.59 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.07 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.5 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  28.49 
 
 
202 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  49.25 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  36.59 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  29.25 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.75 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.39 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.19 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.26 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  34.82 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  35.51 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  44.44 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.61 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34.26 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.71 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.98 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.21 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  38.32 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  39.29 
 
 
189 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.68 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.45 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.67 
 
 
182 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.47 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.8 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.47 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  30.52 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  41.46 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  44.16 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  35.48 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  35.48 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  37.5 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  38 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  36.72 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  41.12 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.19 
 
 
192 aa  44.7  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  27.71 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  37.76 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  35.16 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  28.21 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  37.74 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  30.99 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  37.62 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  31.73 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.26 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  40 
 
 
179 aa  42  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  33.33 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  25.4 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  28.07 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>