164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2134 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  100 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  61.42 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  40.4 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  39.38 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  41.94 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  39.8 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.19 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  43.89 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  36.45 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  41.85 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  39.49 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  39.49 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.78 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  30.61 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  41.84 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  38.02 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.46 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  36.26 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.82 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  39.02 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  42.13 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  37.16 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  34.64 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  37.16 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.82 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  36.26 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  32.54 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  38.02 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  35.52 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.38 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  37.01 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  35.71 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  32.96 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.31 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  32.96 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  35.67 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.88 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  39.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.7 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.25 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.97 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  38.73 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  52.44 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  35.58 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.94 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.03 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.84 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  47.67 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  38.79 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.65 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  50.55 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.17 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  43.33 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.71 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  32.48 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  40.17 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  37.37 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  31.85 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  31.85 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  31.85 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  47.19 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  34.09 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.85 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  31.85 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  31.21 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.85 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  34.78 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  31.21 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  31.1 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  37.36 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.01 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.54 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.54 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  36.69 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  31.21 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  39.76 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  35.77 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  34.88 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  33.76 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.31 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30.72 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  39.6 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  40.68 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  35.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  38.5 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  50.67 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  34.34 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  41.18 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  31.01 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  29.38 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.38 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  33.91 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  50.67 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.48 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  41.18 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>