157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1274 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  100 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  62.84 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  60.22 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  60.22 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  48.15 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  46.93 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  47.46 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.8 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  48.17 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.88 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.1 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.47 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  39.55 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  39.55 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  44.37 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  42.55 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  42.29 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  40.25 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.7 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  38.51 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  40.51 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.06 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  40.56 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  45.3 
 
 		 231 aa  84.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.24 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.84 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  30.91 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.36 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  33.73 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.01 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  35.03 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  42.31 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  40.69 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  35.81 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.96 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  38.27 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  27.54 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  39.87 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  39.42 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.13 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.39 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.34 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.14 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.9 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35.46 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  36.65 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  35.88 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.85 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  31.58 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  39.01 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  40.78 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.94 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  36.42 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  38.79 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  32.05 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  36.54 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.5 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.94 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  32.57 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  30.33 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  30.33 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  36.9 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  28.87 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  38.17 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.52 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  37.29 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  35.37 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.26 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  30.92 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  45.68 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  38.97 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  41.38 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.53 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  32.81 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  30.25 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  47.95 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  32 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  29.89 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  33.13 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  31.33 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  40.23 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  44.05 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  34.93 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  40.23 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  47.89 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  35 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  36.69 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  37.69 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  38.67 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  41.77 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  27.49 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  27.98 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  38.3 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>