117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1704 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  100 
 
 
200 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  61.42 
 
 
197 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.46 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  45.71 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  37.97 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.43 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.36 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  31.63 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  36.31 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  36.31 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  34.21 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  48.09 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  34.47 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  33.18 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.68 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  35.54 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  40.77 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  30.54 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  35.15 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  41.9 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  41.9 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  35.58 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  35.76 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  48.39 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  30.89 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  49.4 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.85 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.05 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  52.94 
 
 
216 aa  61.2  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  38.19 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  46.15 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.26 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  45.63 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  30.35 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  44.12 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  37.11 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  40.22 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.33 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.22 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  35.88 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  35.77 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.73 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  41.18 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.55 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  30.29 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  36 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.59 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  40.62 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  37.25 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  37.06 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  34 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  29.19 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  31.02 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  37.38 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  34.93 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.58 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  46.67 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.52 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  28.65 
 
 
205 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  45.33 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  33.99 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.26 
 
 
169 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.26 
 
 
169 aa  51.6  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  32.52 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  31.82 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.68 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  31.43 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  40.74 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.45 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  29.93 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  39.56 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  31.43 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.68 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  33.93 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  46.91 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  44.16 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  30.48 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  30.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  31.37 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  30.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  25.9 
 
 
184 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  34.31 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  30.48 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  30.56 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  30.48 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.2 
 
 
192 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.26 
 
 
212 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  32.97 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>