123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  360  7.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  49.43 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  42.31 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  40.12 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  41.57 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  41.57 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.71 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  40.48 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.09 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  36.41 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  32.68 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  34.29 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  39.19 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.85 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.42 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.61 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  33.71 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.02 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.5 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  32.02 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  39.66 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  37.74 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.65 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  31.33 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.25 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  33.91 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  36.17 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.84 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  29.78 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  27.78 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  40.23 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  40.7 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  33.33 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  32.6 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  33.9 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.22 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.42 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  36.11 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  34.84 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  33.62 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  35.25 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  34.38 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  46.91 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  35.11 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  35.5 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  32.5 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  34.13 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  40.95 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  33.54 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  33.11 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  45 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  33.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  38.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  35.57 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  32.86 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  30.17 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  30.39 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  41.18 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.58 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  34.57 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.39 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  31.77 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  30.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  33.99 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  32.9 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  34.05 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  34.38 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  29.22 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  34.08 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  29.38 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.3 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  29.5 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  32.6 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  37.2 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  32.37 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  30.49 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  31.43 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  46.97 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  28.02 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  31.98 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  29.73 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.52 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  29.68 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  31.06 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  32.68 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  29.49 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  32.68 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  29.94 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  27.37 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  27.37 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  31.9 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  32.67 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  33.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  40 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  28.22 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>