More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0067 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
400 aa  793    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  52.82 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  48.74 
 
 
399 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  46.94 
 
 
407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  50.43 
 
 
374 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  44.22 
 
 
404 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  45.21 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  48.83 
 
 
393 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  41.9 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  41.73 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  44.51 
 
 
371 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  45.48 
 
 
372 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  41.85 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42.25 
 
 
398 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  42.06 
 
 
424 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  44.29 
 
 
396 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  43.7 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  42.86 
 
 
400 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  42.86 
 
 
400 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  42.86 
 
 
400 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  41.02 
 
 
377 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  40.82 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  41.78 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  40.6 
 
 
398 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  40.94 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  39.79 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.9 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  37.3 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  40.28 
 
 
467 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
370 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  40.73 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  36.51 
 
 
394 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 
415 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
372 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  38.48 
 
 
408 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  34.51 
 
 
380 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  35.18 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  39.4 
 
 
400 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 
411 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
371 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  39.11 
 
 
388 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  36.02 
 
 
415 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  38.73 
 
 
351 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  34.07 
 
 
423 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  35.99 
 
 
388 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  35.99 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  34.72 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  34.78 
 
 
496 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
413 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.35 
 
 
405 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.1 
 
 
381 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 
392 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  34.18 
 
 
395 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  36.87 
 
 
393 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  31.88 
 
 
418 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  34.94 
 
 
396 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 
386 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.65 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 
411 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 
376 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.19 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.33 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 
373 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.97 
 
 
408 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.16 
 
 
408 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.45 
 
 
402 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  30.81 
 
 
408 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.82 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.48 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  30.32 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 
399 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.58 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.86 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  31.59 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.32 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  27.52 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  26.67 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.45 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.45 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.17 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.22 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  25.61 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  26.9 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  32.73 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.9 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.17 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.42 
 
 
382 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  26.98 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.95 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  26.98 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>