More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4265 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  49.29 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  45.28 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  44.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  48.15 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  45.37 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.17 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  40.19 
 
 		 400 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  48.21 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  37.17 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.14 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.98 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  50 
 
 		 121 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  34.23 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  32.89 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  34.44 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.66 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  44.09 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  34.06 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  35.71 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  37.61 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.75 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  33.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  41 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 551 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.17 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 298 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  32.37 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  34.55 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  32.37 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.08 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  36.94 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  23.53 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.54 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.87 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  34.18 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.72 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.06 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.05 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.87 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.99 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  41.58 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  34 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>