More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1962 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
467 aa  966    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  45.51 
 
 
320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  38.53 
 
 
305 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  42.47 
 
 
657 aa  154  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  42.46 
 
 
338 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  40.41 
 
 
416 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  39.15 
 
 
416 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  36.29 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  45.2 
 
 
438 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  38.89 
 
 
727 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  40.86 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  37.44 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  40.68 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  39.5 
 
 
311 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 
331 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  39.18 
 
 
329 aa  140  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  36.76 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  43.39 
 
 
419 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  39.25 
 
 
436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  38.61 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  41.44 
 
 
417 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  39.71 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  42.94 
 
 
415 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 
413 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
424 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  42.41 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.81 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  40.88 
 
 
406 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  37.06 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.41 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  39.66 
 
 
425 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  32.92 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  35.78 
 
 
472 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  38.38 
 
 
487 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  35.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  35.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  35.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  35.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  38.07 
 
 
318 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  35.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  35.29 
 
 
472 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  35.61 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  36.41 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  36.27 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.54 
 
 
437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  41.27 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.02 
 
 
451 aa  120  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  39.15 
 
 
428 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  36.67 
 
 
350 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  37.36 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  35.96 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  35.68 
 
 
373 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
444 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
329 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
328 aa  103  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.52 
 
 
308 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
483 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
350 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.98 
 
 
350 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  36.84 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
335 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.34 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.72 
 
 
395 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  33.7 
 
 
652 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.41 
 
 
313 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.65 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
310 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.77 
 
 
357 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
335 aa  93.2  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
334 aa  93.2  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31.4 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  32.96 
 
 
239 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
671 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
318 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.46 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
423 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  34.15 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  34.15 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 
335 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.03 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  25.69 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.81 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>