More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0632 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  58.53 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  45.67 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  46.4 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  41.09 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.91 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.65 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.01 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.4 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.03 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.47 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  25.23 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.23 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.23 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  28.57 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  25.23 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  28.57 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.32 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  28.57 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.57 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>