83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0163 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  58.48 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  57.55 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  58.17 
 
 		 253 aa  315  6e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  52.56 
 
 		 310 aa  311  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  52.96 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  53.1 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  54.11 
 
 		 325 aa  308  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  53.55 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  53.55 
 
 		 305 aa  305  8.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  47.42 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  48.21 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  50.64 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  42.66 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  37.02 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  46.36 
 
 		 233 aa  192  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  44.44 
 
 		 220 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  43.5 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  43.38 
 
 		 228 aa  185  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  40.89 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  37.02 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.05 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.72 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.72 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  32.74 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  32 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  30.2 
 
 		 210 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  28.72 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  29.76 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  28.43 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  27.59 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  26.94 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  27.84 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  27.23 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.42 
 
 		 195 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  28.5 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  28.5 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  27.01 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  27.59 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.42 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.04 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.35 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  26.37 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  27.23 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.31 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.14 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  24.38 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.06 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  23.76 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  25.98 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  24.62 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  25.77 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.02 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.76 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.39 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25.13 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.06 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  25.25 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  22.69 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  21.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  24.88 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  25.13 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  25.57 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.65 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  27.62 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  24.59 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  24.19 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  24.86 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  25.84 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  25.7 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.59 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  23.04 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.56 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  22.91 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  23.04 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  26.78 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.73 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.73 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  21.13 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  32.84 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.08 
 
 		 458 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>