58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4138 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  89.04 
 
 
146 aa  272  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  83.7 
 
 
137 aa  235  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  83.7 
 
 
137 aa  235  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  83.45 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  73.72 
 
 
138 aa  203  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  55.07 
 
 
143 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  46.85 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  36.81 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  36.23 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  36.23 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  36.23 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  34.4 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  31.43 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  31.45 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  32.61 
 
 
163 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  29.6 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  32.79 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  28.99 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.83 
 
 
189 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.93 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.69 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.99 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.34 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  38.78 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.68 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  29.41 
 
 
182 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  27.18 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  27.54 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  22.77 
 
 
178 aa  48.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  27.41 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  28.12 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  31 
 
 
576 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  30.25 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  27.55 
 
 
136 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.41 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  26.32 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  27.35 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  29.59 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  23.58 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  27.73 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.87 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  25.22 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  28.46 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  25.25 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  23.53 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>