More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0074 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  66.27 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 		 254 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  57.25 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  54.12 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  52.55 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  52.16 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  55.6 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  50.2 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  54.62 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  53.88 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  50.79 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  53.17 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  51.6 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  51.41 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  51.5 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  51.07 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  46.43 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  51.03 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  51.08 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  38.46 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.32 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  30.57 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  28.79 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  27.85 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  28.35 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 330 aa  78.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.68 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.68 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.03 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  30.14 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.11 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.11 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.75 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  28.93 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.48 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 		 281 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  40.91 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.03 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.15 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  29.09 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>