More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0814 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  80.98 
 
 
1426 aa  2441    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
1434 aa  2937    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.58 
 
 
969 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.65 
 
 
981 aa  271  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 
961 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 
974 aa  270  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
974 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 
981 aa  266  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  31.96 
 
 
978 aa  183  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  32.18 
 
 
968 aa  178  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  33.54 
 
 
958 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  30.11 
 
 
978 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 
978 aa  175  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.39 
 
 
978 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.39 
 
 
978 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.39 
 
 
973 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.39 
 
 
973 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 
973 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 
973 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 
973 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.61 
 
 
935 aa  168  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.19 
 
 
974 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.22 
 
 
953 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.45 
 
 
928 aa  162  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  29.81 
 
 
932 aa  160  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  32.44 
 
 
979 aa  160  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.9 
 
 
973 aa  156  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.88 
 
 
923 aa  155  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 
817 aa  94.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 
729 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 
856 aa  82.4  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  28.23 
 
 
1031 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 
947 aa  77.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 
760 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.44 
 
 
813 aa  77.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  23.28 
 
 
1074 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.39 
 
 
910 aa  74.3  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
764 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  24.13 
 
 
1020 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
764 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  24.13 
 
 
1020 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  24.13 
 
 
1020 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  24.13 
 
 
1020 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.42 
 
 
942 aa  73.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 
760 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
745 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  23.9 
 
 
1020 aa  72.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 
738 aa  72.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  25.75 
 
 
1030 aa  72  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  25.28 
 
 
992 aa  72  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  25.42 
 
 
761 aa  71.6  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02507  hypothetical protein  34.69 
 
 
815 aa  71.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  23.36 
 
 
807 aa  71.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.37 
 
 
760 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  25.94 
 
 
1029 aa  70.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 
764 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 
764 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 
729 aa  70.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 
764 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
812 aa  69.7  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  25.21 
 
 
1066 aa  69.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 
817 aa  69.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  28.57 
 
 
1070 aa  69.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 
743 aa  69.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  23.44 
 
 
739 aa  69.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  23.84 
 
 
996 aa  68.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 
971 aa  68.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
739 aa  68.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.23 
 
 
759 aa  68.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  23.79 
 
 
758 aa  68.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.23 
 
 
759 aa  68.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  24.78 
 
 
932 aa  68.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
700 aa  68.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.23 
 
 
759 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.23 
 
 
759 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 
1035 aa  67.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  24.07 
 
 
1035 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.14 
 
 
731 aa  67.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 
800 aa  67  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
759 aa  67  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.57 
 
 
1070 aa  67.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  24.07 
 
 
1035 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  24.07 
 
 
1035 aa  67  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
758 aa  66.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
708 aa  66.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.77 
 
 
721 aa  66.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0194  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
993 aa  66.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  22.43 
 
 
733 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  24.79 
 
 
1036 aa  66.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.11 
 
 
722 aa  65.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  22.43 
 
 
733 aa  65.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 
917 aa  65.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  23.72 
 
 
858 aa  65.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  25.48 
 
 
757 aa  65.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 
747 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 
756 aa  64.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
718 aa  64.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
718 aa  64.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>