More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2748 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  302  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  71.72 
 
 
158 aa  213  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
157 aa  148  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
153 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
153 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  46.32 
 
 
170 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
153 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
156 aa  121  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 
152 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  45.99 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
152 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  41.43 
 
 
152 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
151 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  45.86 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.86 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  43.8 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
168 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
173 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
153 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  39.55 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  43.07 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  43.28 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 
157 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
149 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
159 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.43 
 
 
187 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40 
 
 
162 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 
155 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
150 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 
155 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.35 
 
 
151 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
158 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.5 
 
 
155 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
150 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 
148 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
163 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  39.13 
 
 
164 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  39.13 
 
 
164 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
150 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
150 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  36.5 
 
 
145 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
163 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
171 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
150 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
171 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
151 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 
149 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
144 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
136 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
150 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
150 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
163 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  37.86 
 
 
162 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.14 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  43.8 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.88 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>