More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2147 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2147  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  824  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0010107  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0803  protein of unknown function DUF214  75.43 
 
 
402 aa  573  1e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  37.95 
 
 
443 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.54 
 
 
391 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  37.32 
 
 
401 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  37.23 
 
 
400 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  36.47 
 
 
394 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  39 
 
 
402 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  36.17 
 
 
394 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 
658 aa  202  1e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.57 
 
 
402 aa  201  2e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  35.75 
 
 
400 aa  197  2e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  36.56 
 
 
397 aa  198  2e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
403 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  34.61 
 
 
405 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  36.84 
 
 
401 aa  197  4e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
401 aa  197  4e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  35.12 
 
 
401 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  36.65 
 
 
401 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  31.73 
 
 
405 aa  196  8e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  36.91 
 
 
400 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  35.24 
 
 
400 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  7.60178e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  32.43 
 
 
653 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  35.18 
 
 
405 aa  192  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
406 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  35.97 
 
 
406 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  35.84 
 
 
405 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.2 
 
 
642 aa  190  3e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
405 aa  191  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  33.99 
 
 
648 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 
402 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  36.52 
 
 
402 aa  190  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.85 
 
 
412 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
403 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.44 
 
 
403 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  35.66 
 
 
405 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  33.33 
 
 
682 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  33.33 
 
 
682 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  4.32999e-09 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.38 
 
 
404 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.7 
 
 
405 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  32.88 
 
 
456 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.7 
 
 
405 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  37.24 
 
 
410 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
405 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  33.09 
 
 
667 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  33.09 
 
 
667 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32.14 
 
 
404 aa  185  1e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  35.38 
 
 
409 aa  185  1e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  32.94 
 
 
403 aa  184  2e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 
406 aa  184  2e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  34.2 
 
 
668 aa  185  2e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  37.32 
 
 
402 aa  184  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 
398 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.41 
 
 
417 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.58315e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 
404 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  36.94 
 
 
415 aa  184  4e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  36.74 
 
 
414 aa  183  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 
400 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 
405 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.03 
 
 
647 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
408 aa  182  9e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 
418 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  32.76 
 
 
696 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.02561e-08  unclonable  1.13397e-09 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.7 
 
 
405 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  35.15 
 
 
409 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33.5 
 
 
405 aa  181  3e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.51 
 
 
648 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.97537e-08  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  35.24 
 
 
407 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 
400 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.68 
 
 
656 aa  180  5e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.68 
 
 
656 aa  180  5e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  34.2 
 
 
412 aa  180  5e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.38 
 
 
649 aa  179  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  33.17 
 
 
656 aa  179  6e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.51 
 
 
648 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  32.51 
 
 
648 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  32.51 
 
 
648 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.25 
 
 
653 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  32.05 
 
 
409 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.51 
 
 
648 aa  179  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  32.51 
 
 
648 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.38 
 
 
649 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.27 
 
 
648 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  35.66 
 
 
414 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.65799e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.64 
 
 
412 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  35.24 
 
 
409 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.51 
 
 
648 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  32.19 
 
 
678 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.85404e-05  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.19 
 
 
678 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.05037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  32.19 
 
 
678 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
415 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.94 
 
 
657 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.75 
 
 
402 aa  175  1e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.76 
 
 
646 aa  174  2e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.3 
 
 
648 aa  174  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  30.51 
 
 
652 aa  174  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  31.34 
 
 
648 aa  175  2e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  31.34 
 
 
648 aa  175  2e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  34.28 
 
 
405 aa  174  3e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.5 
 
 
671 aa  174  3e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>