More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2034 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
357 aa  704    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  78.31 
 
 
355 aa  554  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.37 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.22 
 
 
356 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
355 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.06 
 
 
356 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 
357 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 
357 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.99 
 
 
358 aa  358  6e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  48.6 
 
 
358 aa  358  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
357 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
355 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.54 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.72 
 
 
355 aa  352  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.38 
 
 
357 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  51.69 
 
 
355 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.73 
 
 
355 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
354 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
355 aa  340  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.08 
 
 
364 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  49.16 
 
 
355 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.94 
 
 
355 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
355 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.41 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.81 
 
 
357 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.33 
 
 
359 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.41 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.94 
 
 
355 aa  299  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.17 
 
 
354 aa  291  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.37 
 
 
344 aa  275  7e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 
353 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.44 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 
365 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.51 
 
 
320 aa  204  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.37 
 
 
400 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.76 
 
 
397 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.12 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.74 
 
 
396 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.39 
 
 
400 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.44 
 
 
353 aa  186  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.13 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.74 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.16 
 
 
287 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.16 
 
 
287 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.15 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.85 
 
 
296 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.85 
 
 
296 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.33 
 
 
296 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.74 
 
 
296 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.33 
 
 
296 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.85 
 
 
294 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.68 
 
 
296 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.09 
 
 
298 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.24 
 
 
293 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.43 
 
 
294 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.06 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.85 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.15 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.89 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2548  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.88 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.257224  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2119  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.43 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.95 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.31 
 
 
302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.43 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2411  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.2 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000385967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.84 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.51 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.38 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.34 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.51 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.21 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.65 
 
 
289 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1619  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.92 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2083  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.53 
 
 
300 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.92 
 
 
292 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
293 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0434  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.91 
 
 
287 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.824963 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
290 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.43 
 
 
294 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
294 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.34 
 
 
287 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.34 
 
 
289 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.33 
 
 
294 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2595  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.1 
 
 
292 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.24 
 
 
293 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.24 
 
 
290 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2862  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.53 
 
 
301 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0696  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.33 
 
 
294 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53714  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0626  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.65 
 
 
294 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.353924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>