56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1790 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  100 
 
 		 395 aa  771    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  58.23 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  40.72 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.24 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  27.91 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.22 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.42 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.25 
 
 		 830 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  28.61 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  29.53 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.06 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  21.38 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  28.12 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  27.3 
 
 		 775 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  24.69 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  23.49 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  23.61 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  23.61 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  24.28 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  23.98 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 193 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  24.15 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  27.65 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  28.15 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  24.15 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  23.8 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  25.09 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  22.3 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  27.1 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  23.37 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  19.75 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  22.93 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2982  ABC-type transport system permease protein 2  26.94 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  21.63 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  22.48 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1321  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.800168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  21.15 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  22.73 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 377 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  52.17 
 
 		 273 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>