15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2982 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2982  ABC-type transport system permease protein 2  100 
 
 		 361 aa  701    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2707  hypothetical protein  61.56 
 
 		 349 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44272  normal  0.031645 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1429  ABC-type transport system permease protein 2  49.56 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0423537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1548  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  49.57 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  34.23 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1462  hypothetical protein  32.96 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0393  hypothetical protein  34.39 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.628295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2287  hypothetical protein  35.24 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  41.49 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  27 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  43.86 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  41.38 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  41.49 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  42.11 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>