More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0623 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  100 
 
 
377 aa  737  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  73.97 
 
 
385 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  60.21 
 
 
306 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  58.82 
 
 
293 aa  326  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  58.63 
 
 
295 aa  303  2e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  50.17 
 
 
314 aa  304  2e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 
370 aa  295  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  54.7 
 
 
297 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  49.33 
 
 
307 aa  273  5e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  42.86 
 
 
307 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  39.51 
 
 
351 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  40.11 
 
 
415 aa  259  5e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  43.75 
 
 
421 aa  252  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  38.4 
 
 
428 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  38.51 
 
 
299 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  40.07 
 
 
466 aa  222  1e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  45.97 
 
 
304 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  53.99 
 
 
355 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  37.8 
 
 
292 aa  205  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.01 
 
 
296 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  39.33 
 
 
400 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
288 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  36.43 
 
 
288 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.75951e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  36.08 
 
 
288 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  36.08 
 
 
288 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  39.69 
 
 
409 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.66 
 
 
280 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  36.68 
 
 
471 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  35.71 
 
 
288 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  33.94 
 
 
285 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.21 
 
 
280 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  36.67 
 
 
399 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.08 
 
 
281 aa  148  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.45254e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  33.45 
 
 
300 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.19 
 
 
304 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 
277 aa  141  2e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.59 
 
 
278 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.59 
 
 
278 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.27 
 
 
277 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  36.14 
 
 
287 aa  137  3e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.8 
 
 
279 aa  136  6e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.88 
 
 
289 aa  136  7e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  34.34 
 
 
287 aa  135  2e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56655e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  34.92 
 
 
312 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.54 
 
 
276 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  34.97 
 
 
291 aa  132  8e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.17 
 
 
312 aa  131  2e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.75 
 
 
289 aa  131  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  33.7 
 
 
297 aa  130  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  33.7 
 
 
297 aa  130  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  33.7 
 
 
297 aa  130  5e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  32.71 
 
 
286 aa  128  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  33.21 
 
 
285 aa  128  2e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  29.59 
 
 
441 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  32.87 
 
 
292 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  33.21 
 
 
285 aa  127  4e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  27.23 
 
 
447 aa  126  5e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.21 
 
 
285 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  34.62 
 
 
297 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  36.47 
 
 
280 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  29.32 
 
 
441 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.08 
 
 
278 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.08 
 
 
278 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.71 
 
 
286 aa  122  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 
386 aa  121  2e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.18 
 
 
290 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.36 
 
 
286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.36 
 
 
286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.36 
 
 
286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.18 
 
 
290 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.36 
 
 
286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.86 
 
 
285 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  36.47 
 
 
281 aa  120  4e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  27.3 
 
 
368 aa  120  4e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  29.39 
 
 
293 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  35.5 
 
 
312 aa  117  2e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.6 
 
 
290 aa  118  2e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  32.03 
 
 
286 aa  117  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.73 
 
 
285 aa  117  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  35.34 
 
 
301 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.31 
 
 
278 aa  116  7e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  32.34 
 
 
290 aa  115  9e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  32.09 
 
 
294 aa  115  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  32.09 
 
 
294 aa  115  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  34.62 
 
 
295 aa  115  1e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.89 
 
 
286 aa  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  36.64 
 
 
280 aa  114  2e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  32.09 
 
 
294 aa  114  2e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.58 
 
 
283 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.15 
 
 
294 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  30.31 
 
 
290 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  32.18 
 
 
294 aa  114  4e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  30.23 
 
 
366 aa  113  4e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.71 
 
 
291 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.92 
 
 
290 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
370 aa  113  7e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  31.68 
 
 
287 aa  112  8e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  32.2 
 
 
285 aa  112  1e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.57 
 
 
285 aa  111  2e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89097e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  28.57 
 
 
285 aa  111  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  8.69047e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>