More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3377 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  43.17 
 
 		 1156 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  40 
 
 		 1180 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  39.92 
 
 		 1180 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  69.52 
 
 		 1147 aa  1431    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  41.13 
 
 		 1202 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  43.44 
 
 		 1164 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  34.34 
 
 		 1155 aa  644    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  100 
 
 		 1165 aa  2246    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  68.91 
 
 		 1147 aa  1373    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  42.35 
 
 		 1161 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  42.98 
 
 		 1151 aa  673    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  43.73 
 
 		 1164 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  42.95 
 
 		 1159 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  40.44 
 
 		 1156 aa  676    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 1162 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  43.28 
 
 		 1161 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.87 
 
 		 1177 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  64.84 
 
 		 1157 aa  1183    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  39.98 
 
 		 1183 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  68.91 
 
 		 1147 aa  1377    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  39.73 
 
 		 1182 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  65.38 
 
 		 1157 aa  1250    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  40.89 
 
 		 1189 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  39.93 
 
 		 1180 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  39.75 
 
 		 1183 aa  622  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  41.03 
 
 		 1187 aa  582  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  43.45 
 
 		 1167 aa  582  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  38.41 
 
 		 1157 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  38.24 
 
 		 1185 aa  545  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  38.84 
 
 		 1124 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.13 
 
 		 1183 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  36.47 
 
 		 1125 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  38.58 
 
 		 1120 aa  509  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 		 1121 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  39.28 
 
 		 1106 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  39.3 
 
 		 1119 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  39.43 
 
 		 1106 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  36.11 
 
 		 1161 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  29.12 
 
 		 1089 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  36.29 
 
 		 1142 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  36.24 
 
 		 1166 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 854 aa  341  4e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.96 
 
 		 860 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  31.56 
 
 		 1147 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.61 
 
 		 907 aa  187  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 1095 aa  183  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1177 aa  183  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 1173 aa  176  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 1087 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.25 
 
 		 1089 aa  153  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 1117 aa  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.54 
 
 		 1241 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 		 1168 aa  146  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.35 
 
 		 1241 aa  146  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.91 
 
 		 1241 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 1101 aa  144  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.76 
 
 		 1241 aa  144  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  29.34 
 
 		 1173 aa  144  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 1140 aa  144  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.95 
 
 		 1241 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.19 
 
 		 1241 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.43 
 
 		 1241 aa  141  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.43 
 
 		 1241 aa  141  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.03 
 
 		 1240 aa  141  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.42 
 
 		 1242 aa  141  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.24 
 
 		 1241 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 1173 aa  139  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.63 
 
 		 1086 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 1107 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  55.38 
 
 		 1157 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.44 
 
 		 1197 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.87 
 
 		 1168 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 1080 aa  132  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 1103 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  24.87 
 
 		 1244 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  29.55 
 
 		 1187 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1057 aa  125  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.74 
 
 		 1244 aa  126  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 1115 aa  121  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 1240 aa  118  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 1162 aa  116  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03906  exodeoxyribonuclease V beta chain  29.86 
 
 		 1357 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 1101 aa  115  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1061 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  24.26 
 
 		 1282 aa  112  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 1185 aa  112  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 1110 aa  110  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 1121 aa  110  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.93 
 
 		 1251 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  22.43 
 
 		 1248 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.1 
 
 		 1286 aa  106  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1076 aa  105  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.77 
 
 		 1242 aa  105  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.52 
 
 		 1320 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.98 
 
 		 1233 aa  104  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 1196 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.03 
 
 		 1217 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1076 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  24.38 
 
 		 915 aa  100  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  22.03 
 
 		 1217 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>