More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3372 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  47.9 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 
287 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  42.01 
 
 
314 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.3 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
270 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 
282 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.55 
 
 
270 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 
270 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.64 
 
 
270 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.18 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
270 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
278 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
270 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 
270 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 
270 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 
262 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.74 
 
 
270 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
265 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
284 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
267 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
277 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
270 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
273 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
271 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.26 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
265 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.72 
 
 
266 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.73 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  25 
 
 
265 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
263 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.1 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
265 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
273 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
278 aa  89  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  29.3 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
294 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
265 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.35 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.61 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  28.73 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  23.48 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.31 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.14 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  30.66 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>