More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1774 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
377 aa  765    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  80 
 
 
373 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  68 
 
 
372 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  66.93 
 
 
375 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  58.38 
 
 
371 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  61.72 
 
 
388 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  56.95 
 
 
372 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  56.22 
 
 
373 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  57.49 
 
 
372 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  54.32 
 
 
371 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.32 
 
 
371 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  53.78 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  55.61 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.73 
 
 
371 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  53.44 
 
 
368 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  49.46 
 
 
371 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  49.19 
 
 
371 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  50.69 
 
 
370 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  50.69 
 
 
372 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  50.83 
 
 
368 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  49.04 
 
 
373 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  47.37 
 
 
371 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  48.65 
 
 
371 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  52.16 
 
 
417 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
366 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  48.62 
 
 
372 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  48.53 
 
 
368 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 
364 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  50.74 
 
 
371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  50.44 
 
 
413 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  46.81 
 
 
366 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  47.93 
 
 
368 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  46.94 
 
 
373 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  46.38 
 
 
368 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  50.15 
 
 
374 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  50.29 
 
 
378 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  46.38 
 
 
368 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  50.15 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  50.15 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  46.09 
 
 
368 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  47.48 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1054  extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 
370 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  48.67 
 
 
370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  49.13 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0988  Extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
371 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0919893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50 
 
 
380 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  49.56 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  48.13 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  43.49 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1184  Extracellular ligand-binding receptor  43.36 
 
 
370 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  47.94 
 
 
370 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  44.71 
 
 
367 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  43.92 
 
 
373 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  42.73 
 
 
373 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  42.7 
 
 
374 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.7 
 
 
374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  42.73 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  42.6 
 
 
372 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 
371 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  42.39 
 
 
370 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 
371 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.11 
 
 
371 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.6 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  42.6 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.6 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 
371 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 
371 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.31 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  42.31 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  42.31 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  42.31 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  40.11 
 
 
371 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 
375 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  40.73 
 
 
371 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 
375 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  41.42 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  41.72 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  40.38 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  41.72 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  41.42 
 
 
372 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  39 
 
 
371 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  41.72 
 
 
358 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  40.92 
 
 
375 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  41.42 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  39.82 
 
 
374 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  39.82 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  37.88 
 
 
369 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  38.16 
 
 
369 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  38.16 
 
 
369 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03307  leucine transporter subunit  37.88 
 
 
369 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03260  hypothetical protein  37.88 
 
 
369 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  39.82 
 
 
370 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  38.72 
 
 
366 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  38.64 
 
 
370 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>