More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0547 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 358 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.25 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.3 
 
 		 358 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.72 
 
 		 358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.65 
 
 		 359 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.09 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  61.65 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.12 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.79 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.96 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.18 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.9 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.75 
 
 		 364 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.29 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  54 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  55.78 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.7 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.7 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.56 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.45 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.59 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.18 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.85 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.94 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.21 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  54.02 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.17 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.91 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.33 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  50.84 
 
 		 367 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 		 362 aa  291  8e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.86 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.14 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.9 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.77 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.59 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.55 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.47 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.23 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.06 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 351 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.22 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.05 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.23 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.88 
 
 		 346 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.12 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.65 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.12 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.7 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  42.98 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.63 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.17 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  40.52 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.47 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.01 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  46.88 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 		 339 aa  249  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  42.37 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  41.86 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.18 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  42.82 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>