62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0246 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  90.46 
 
 		 367 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  91.01 
 
 		 367 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  73.03 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  71.51 
 
 		 359 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  71.55 
 
 		 356 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  71.35 
 
 		 356 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  70.31 
 
 		 360 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  69.17 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  74.53 
 
 		 323 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  73.2 
 
 		 370 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  65.28 
 
 		 371 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.66 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.98 
 
 		 365 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  52.51 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  60.06 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  48.89 
 
 		 374 aa  292  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  51.71 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  50.45 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  26.52 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  24.73 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  25.44 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  34.29 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  22.94 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  21.81 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  27.39 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.62 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  24.75 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  30.53 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  28.57 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  20.63 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  27.2 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.37 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.01 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  25.36 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  22.35 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.34 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  25.93 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.58 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.77 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>