More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2143 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  100 
 
 		 302 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  59.15 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  54.58 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.86 
 
 		 310 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.17 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  55.33 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  56.6 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.6 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  52.84 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.4 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  54.01 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  47.23 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  47.23 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  51.54 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  56.14 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  48.39 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  51 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  45.82 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  51.86 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  51.19 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.65 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  50.85 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  50.85 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  50.85 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  43.43 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  43.52 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  47.56 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  47.56 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  46.91 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  51.7 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  48.81 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  50.53 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  45.55 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  48.06 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  39.59 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40.29 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  33.56 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  40.83 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  31.7 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  35.71 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.61 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  40.48 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  38.49 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  38.11 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  39.51 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  39.24 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  33.95 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  37.8 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  37.96 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  35.54 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  37.33 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  38.91 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  40.75 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.14 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.92 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  35.81 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  34.86 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  34.17 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.14 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  37.84 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  35.64 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.02 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  49.14 
 
 		 119 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  31.41 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.34 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  33.92 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  33.96 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  31.34 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.96 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.05 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  34.01 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.07 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.14 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.27 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  34.17 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  29.67 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  31.64 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  30.79 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  28.68 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.34 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  25.34 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>