More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0082 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 331 aa  677    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  81.16 
 
 		 329 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  77.74 
 
 		 331 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  77.88 
 
 		 330 aa  522  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  76.9 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 		 330 aa  428  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 337 aa  417  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.26 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 331 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 331 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 332 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  59.44 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 332 aa  391  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  57.72 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  54.55 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 		 329 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  56.57 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 		 333 aa  384  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 		 333 aa  384  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  58.95 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  54.55 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  54.55 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  56.17 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  53.94 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  54.85 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>