225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1103 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
255 aa  507  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  89.02 
 
 
260 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  77.47 
 
 
253 aa  357  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  64.63 
 
 
255 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  66.94 
 
 
251 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  62.65 
 
 
266 aa  291  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 
254 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  59.84 
 
 
258 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  52.57 
 
 
257 aa  273  2e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
255 aa  265  6e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 
260 aa  264  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
256 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 
256 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  56 
 
 
254 aa  262  5e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  57.66 
 
 
260 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  54 
 
 
254 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  58.7 
 
 
262 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  57.66 
 
 
255 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 
256 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 
257 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 
273 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 
256 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
255 aa  248  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 
255 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
256 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
255 aa  244  1e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 
259 aa  244  1e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  51 
 
 
256 aa  243  2e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 
254 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
274 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 
255 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
254 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
254 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
252 aa  235  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
254 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  45.97 
 
 
254 aa  232  4e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
256 aa  231  7e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
258 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  50.99 
 
 
257 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
254 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
252 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 
251 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
264 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 
251 aa  224  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
254 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
254 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 
254 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 
255 aa  222  5e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 
253 aa  222  5e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 
261 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  51.42 
 
 
260 aa  220  2e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 
257 aa  220  2e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
253 aa  220  2e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 
253 aa  220  2e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 
304 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44 
 
 
253 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
253 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
253 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
253 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
253 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
256 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
256 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.18 
 
 
255 aa  216  3e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 
252 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
255 aa  215  6e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 
255 aa  215  6e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 
253 aa  215  6e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 
254 aa  215  6e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
251 aa  214  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
255 aa  214  1e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.6 
 
 
253 aa  214  1e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
255 aa  214  1e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 
253 aa  213  2e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  45.97 
 
 
260 aa  213  3e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  49.38 
 
 
254 aa  212  4e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 
254 aa  212  6e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
257 aa  212  6e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
250 aa  211  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 
245 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 
245 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.33292e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 
245 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.36688e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
252 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
253 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
250 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 
255 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  47.13 
 
 
250 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
252 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 
245 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
255 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 
250 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 
250 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
245 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
244 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
254 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
247 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
256 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>